Hiába számít a Twin Ring Motegi a Honda hazai pályájának, akárcsak a tavalyi versenyen, az idei nagydíj első szabadedzésén is egy Yamaha bizonyult a leggyorsabbnak, miután Jorge Lorenzo egyedüliként tudta áttörni az 1:46-os határt. Mögötte a címvédését bebiztosítani készülő Marc Marquez lett a második, megelőzve a Ducatival ismét jól kezdő Andrea Doviziosót.