Hat hónap letöltendő börtönbüntetést kapott az amerikai sportoló, mivel az ügyészek bizonyítékainak hittek jobban az atléta ügyét vizsgáló bírák. A védők fellebbeztek és próbaidőt kértek, az olimpiai érmeitől megfosztott sportolónak.
Jones "bűn"listája igen változatos, amelyben van hamis tanúzás, csekkhamisítás és tiltott szerekkel való visszaélés is. A sprintert nem csak itt érte el a balsor keze, ugyanis a sport világa már kiosztotta a sport világának büntetését, ami nem kevesebb mint, hogy megfosztották olimpiai- és világbajnoki érmeitől, ráadásul eltiltották az olimpiától is. Ezen felül jelentős számú támogatója kívánja visszakövetelni tőle szponzori- és rajtpénzeket.
A 32 éves Jones október 5-én vallotta be, hogy – bár tudtán kívül, de – 1999-től két éven át doppingszereket használt. A "tiszta" nevű szteroidokat tartalmazó készítményt – amelyet a THG-t is gyártó BALCO laboratórium állított elő – akkori edzőjétől, Trevor Grahamtől kapta, aki állítása szerint neki csak annyit mondott az anyagról, hogy táplálék-kiegészítőket tartalmazó lenmagolaj.
A sydneyi olimpián, valamint a 2001-es vb-n is remeklő Jones – aki soha nem bukott meg a doppingvizsgálatokon -, a vallomással egy időben bejelentette visszavonulását.
Az amerikai sztár Sydneyben megnyerte a 100 és 200 m-t, valamint a 4×400-as váltót, bronzérmes lett 4×100-as stafétával, valamint távolugrásban. Az edmontoni világbajnokságon második lett 100-on, és megnyerte a 200-at.
